兵部也自此也多了一個名字：大漢護民軍總司令部。
兵部下設：參謀總署、海軍總署（海軍司令部）、陸軍總署（陸軍司令部）、武安總署、撫慰總署、後勤總署、軍情總署、軍監總署、軍事學院和訓練營。
參謀總署署長，也就是護民軍總參謀長郭嘉；
海軍總署署長兼海軍司令管承，參謀長劉奇；
陸軍總署署長兼陸軍司令張合，參謀長于禁；
武安總署署長厲志（接受兵部與內閣雙重管轄），武安司令禇燕；
撫慰總署署長兼撫慰主使何山；
後勤總署署長趙寶，參謀長姜冏；
軍監總署署長兼主使皇甫嵩，副使邢虎；
軍情總署署長趙謙，參謀長席草；（趙謙原來就管着野草軍）
軍事學院院長鮑信；
訓練營總教官鮑韜，副總教官高順。
至於還有一個朱儁，他年事已高，實在不適合擔任甚麼實職。於是，經他自己提議，他擔任兵部參議。
也就是想來兵部就來，想走就走。
反正他就是想給自己找點事兒做，根本閒不下來。
至於撫慰總署，蔡成也給大家解釋清楚了。
日後，護民軍的征戰目標，離大漢本土的距離越來越遠，將士們的思鄉之情、戀家之情，都會對戰力有所影響。
所以，需要軍中有能夠撫慰將士思鄉之情、培養將士爲國征戰信念的角色。
軍事主官與撫慰使之間的分工是：作戰與訓練，全由軍團長負責；其他事情，全由撫慰使負責。
所有的撫慰使，都要入軍事學院培訓至少半年。
當然，蔡成也沒有諱言，設置撫慰總署的目的就是加強對護民軍的掌控。
大軍遠征在外，如果不強化掌控，朝廷中會有人不放心。
也就是說，每一支護民軍，都必須由兩個體系控制：軍事主官體系控制訓練、行軍、打仗，撫慰使體系控制軍隊的士氣、情緒、後勤、軍法、評功、任免等。
撫慰使從軍團一直設到團，撫慰郎則設到營和大隊。
說白了，就是後世的“政委系統”，並與“軍事主官系統”的相互制衡。
以其他人的理解來看，這就是“大漢監軍系統”的強化版。
可如此一來，監察系統不就弱化了嗎？
一點沒有。
監察系統由兵部直接掌控，負責抽查、巡查，不屬於各軍；
撫慰系統則是融于軍中，且有實際職權。
在兵部之下，設置海軍與陸軍兩個兵種。
其中海軍設渤海艦隊、東海艦隊、南海艦隊和護商艦隊，以及沓氏海軍基地、瀛州海軍基地、不其海軍基地、朐縣海軍基地、夷州海軍基地、崖州海軍基地和林邑海軍基地。
林邑，就是後世越南的峴港。
待完全控制兩洋海峽（馬六甲海峽）後，也將在海峽轉角處（後世的新加坡）設置一個海軍基地。
海軍基地負責培訓海軍兵員，管理港口，後勤支持等。