次要原因是16世紀的日本正處於戰國時代，戰亂頻繁，
大量戰敗的武士、浪人和失地農民成爲倭寇的重要組成部分。
他們與中國的武裝海商集團勾結，使倭寇的戰鬥力和組織性大爲增強。
與嘉靖時期，明朝政治腐敗，軍事上重文輕武，海防鬆弛。
面對機動靈活的倭寇，裝備和戰術都相對落後的明軍難以有效應對，
導致倭寇屢剿屢起，造成了歷史上有名的“嘉靖大倭寇”。
可實際上導致倭患的根本原因，還是嘉靖上位後，突然將在宣宗、孝宗、
武宗時期逐漸廢除的“片板不許下海”太祖朱元璋的政策又撿了起來，還搞嚴厲打擊。
這斷絕了沿海民衆通過合法海外貿易謀生的途徑，導致大量商人、
漁民轉爲走私甚至海盜，爲倭寇提供了主要兵源和內應。
着名的倭寇頭目、堪稱大明海賊王的王直、鄭芝龍都是貨真價實的明朝人，
而不是從日本流竄出來的落魄武士、浪人。
總的來說，鹽和茶的禁榷制度是古代國家經濟的重要支柱，
但同時也限制了民間商業的發展，催生了私鹽、
私茶貿易，並在一定程度上激化了社會矛盾。